D’après ce lien :

• un système plus bicaméral et moins de blocages au Conseil, grâce à davantage de décisions prises à la majorité qualifiée et à la procédure législative ordinaire ;
• un droit d’initiative législative à part entière et un rôle de co-législateur pour le Parlement en ce qui concerne le budget à long terme ;
• une révision des règles de composition de la Commission (rebaptisée “exécutif européen”), y compris l’élection de son président (la nomination devant être faite par le Parlement et l’approbation par le Conseil européen - un renversement du processus actuel), la limitation du nombre de commissaires à 15 (par rotation entre les États membres), la possibilité pour le président de la Commission de choisir son collège sur la base de préférences politiques en gardant à l’esprit l’équilibre géographique et démographique, et un mécanisme de censure des commissaires individuels ;
• une plus grande transparence au sein du Conseil grâce à la publication des positions des États membres de l’UE sur les questions législatives ;
• une plus grande participation des citoyens grâce à l’obligation pour l’UE de créer des mécanismes de participation appropriés et au renforcement du rôle des partis politiques européens.

Quelques changements manquants dans ce lien que j’ai trouvé intéressant :

• Le passage de “Haut représentant” à “Secrétaire de l’Union” et de “Président du Conseil européen” à “Président de l’Union européenne”.
• Le Parlement choisit désormais lui-même la répartition de ses sièges entre les Etats membres.